En una máquina de pruebas de Windows 2012 me ha sucedido que no podía arrancar máquinas virtuales porque decía que el hypervisor no estaba corriendo. Después de comprobar que las extensiones de virtualización estaban habilitadas en la BIOS, he descubierto que hay que añadir un parámetro en el boot loader de Windows para que arranque automáticamente el hypervisor.
Para ello, usaremos el comando bcdedit.exe como administrador. Si lo ejecutamos sin parámetros, podemos ver la configuración actual, y para añadir la opción de autoarranque: